Aperçu des sections

  • Généralités

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  • Fonction et physiologie microbienne (Cours)

    Ce cours présente les principes fondamentaux de la fonction et de la physiologie des microorganismes. Il traite des principaux groupes microbiens, de leurs besoins nutritifs, de leur croissance, de leur métabolisme, de leur différenciation et de leurs interactions avec leur environnement et l'hôte. Il met également en évidence les applications des microorganismes en biotechnologie, en santé et en environnement.

  • Fiche contact

    Université: Abou Bakr Belkaid de TLEMCEN
    Faculté: sciences de la nature et de la vie de la terre et de l'univers 
    Département Agronomie
    Enseignants: Imane M'HAMEDI / Waffa BOUALI
    Emails: imene.mhamedi@yahoo.fr/ wafaa_bio@yahoo.fr

    Intitulé du master: Biologie de la nutrition
    Intitulé de la matière : Fonction et physiologie microbienne

    Unité l’enseignement : Unité d’Enseignement découverte 1

    Crédit : 2
    Coefficient : 2

    Volume horaire hebdomadaire

    Cours

    TD

    TP

    Stage

    1h30

    /

    1h30

    /

    Mode d'évaluation: Examen (60%)+contrôle continue (40%)

  • Carte conceptuelle

  • Plan du cours

  • Objectifs généraux

    - l'objectif de ce cours est d'approfondir les connaissances de la physiologie des microorganismes, notamment ceux qui sont impliqués dans des interactions microorganisme-microorganismes, microorganismes-hôte et ceux qui présentent un intérêt pour les biotechnologies.

    - À l'issue de ce cours, l'étudiant sera capable de :

    1. Identifier les principaux groupes de microorganismes et décrire leurs caractéristiques physiologiques.
    2. Expliquer les mécanismes de la différenciation bactérienne.
    3. Décrire les besoins nutritifs des microorganismes et expliquer leur influence sur le métabolisme microbien.
    4. Expliquer les différentes phases de la croissance bactérienne ainsi que les facteurs qui les influencent.
    5. Analyser les mécanismes physiologiques impliqués dans les interactions microorganisme–microorganisme et microorganisme–hôte.
    6. Comparer les caractéristiques physiologiques des principaux groupes microbiens en fonction de leur mode de vie et de leur environnement.
    7. Évaluer l'intérêt des microorganismes dans les applications biotechnologiques à partir de leurs propriétés physiologiques.
    8. Interpréter des résultats expérimentaux relatifs à la physiologie des microorganismes afin d'en tirer des conclusions scientifiques.



  • Prérequis

    L’étudiant doit avoir acquis au cours des années précédentes, les fondements de la microbiologie et de l’ enzymologie.

    • Décrire la structure et l'organisation de la cellule procaryote et de la cellule eucaryote.
    • Identifier les principaux groupes de microorganismes et leurs caractéristiques générales.
    • Expliquer les notions fondamentales de microbiologie générale (classification, morphologie, reproduction et diversité microbienne).
    • Décrire les bases de la biochimie cellulaire, notamment la structure et le rôle des biomolécules, des enzymes et des principales voies métaboliques

  • Chapitre 1 : Le monde microbien

    L’homme n’a eu connaissance de la présence des microorganismes que depuis à peine un siècle et demi, bien que ceux-ci soient présents depuis la nuit des temps.

    cette première partie est consacrée au monde microbien, sa diversité et ses caractéristiques.


  • Chapitre 2: La structure bactérienne

    Les microorganismes constituent un groupe très diversifié, ils existent à l'état de cellule isolée ou en groupe, les bactéries présentent une grande diversité de morphologies cellulaires.  Cette caractéristique est exploitée pour l’identification de la cellule par observation microscopique 


  • Chapitre 3: Nutrition, croissance et physiologie bactérienne

    Connaitre les principaux éléments de la physiologie bactérienne : croissance bactérienne, mode respiratoire, et application à l’identification bactérienne

  • Chapitre 4: Fermentations, production de métabolites, applications industrielles

    Les microorganismes présentent un intérêt économique considérable, voire irremplaçable, dans de nombreux secteurs industriels. Généralement, on les cultive pour obtenir des cellules entières, des enzymes et divers métabolites. 

  • chapitre 5: Le biofilm microbien

    Les microorganismes peuvent développer deux modes de vie, l’état libre planctonique où les microorganismes vivent de façon isolés, et l’état sessile où les microorganismes sont adhérés a une surface et enrobés de matrice exopolysaccharidique (EPS), formant une vraie communauté structurée sous le nom de biofilm.


  • Chapitre 6: Le microbiote intestinal

    Le microbiote intestinal est un écosystème complexe  qui comprend l’ensemble des micro-organismes (principalement des bactéries) qui colonisent le tube digestif humain. les micro-organismes du tractus digestif assurent des fonctions essentielles pour le maintien et la santé de l’hôte

  • Chapitre 7: Les virus

    Tous les organismes vivants sont potentiellement sensibles à un ou plusieurs virus. Un virus est une entité biologique qui nécessite une cellule hôte, dont il utilise les constituants pour se multiplier. Les virus existent sous une forme extracellulaire ou intracellulaire.

  • Références bibliographiques

    - Bramhachi P.V. (2019) Implication of Quorum Sensing and Biofilm Formation in Medicine, Agriculture and food industry. Springer Nature Singapore Pte Ltd. ISBN: 978-981-32-9408-0.

    -El Kaoutari, A., Armougom, F., Raoult, D., & Henrissat, B. (2014). Le microbiote intestinal et la digestion des polysaccharides. médecine/sciences, 30(3), 259-265.

    - Landman, C., & Quévrain, E. (2016). Le microbiote intestinal: description, rôle et implication physiopathologique. La Revue de médecine interne, 37(6), 418-423.

    - Meyer, A., DEIANA, J., BERN ARD,A. (2004). Cours de microbiologie générale avec problèmes et exercices corrigés (2ème édition). Biosciences et techniques.

    - Perry J., Staley J. et Lory S. (2004) Microbiologie. Dunod. ISBN: 978-2100072347

    - Prescott, L. M., Harley, J. P., Klein, D. A., & Willey, J. M. (2010). Microbiologie. De Boeck Supérieur.

    - Tommorano G. (2019) Quorum Sensing: Molecular Mechanism and Biotechnological Application. Published by Elsevier Inc. ISBN: 978-0-12-814905-8.


  • Examen final