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  • Généralités

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    • Table des matières 

      I. Informations sur le cours ................................................................... 3 

      II. Présentation du cours ...................................................................... 4 

      III. Contenu .......................................................................................... 5 

      IV. Pré-requis ....................................................................................... 9 

      V. Place du cours dans le programme ................................................ 10 

      VI. Visées d’apprentissage ................................................................. 10 

      VII. Modalités d'évaluation des apprentissages ................................. 11 

  • I. Informations sur le cours

    • Université de Tlemcen   

      Faculté: des sciences 

      Département: Chimie 

      Public cible : 2ème année Master   

      Intitulé du cours : Travaux pratiques en modélisation moléculaire  

      Il est calculé avec le cours 

       Durée : 01semaines 

      Horaire: Mardi: 08h30-11h30 

      Salle: Salle Informatique

  • II. Présentation du cours

    • Les travaux pratiques, souvent abrégés en TP, constituent un type d'enseignement fondé sur 

      l'apprentissage pratique avec en particulier la réalisation d'expériences permettant de vérifier et compléter les connaissances dispensées dans les cours théoriques. 

      Les travaux pratiques concernent généralement les sciences expérimentales. Contrairement aux autres types de cours qui se passent exclusivement à l'oral ou à l'écrit, les séances de travaux  pratiques nécessitent souvent un ordinateur (PC). 

      Les travaux pratiques sont une mise en application (et une mesure de la maîtrise par les 

      étudiants) de la méthode scientifique, basée sur la pose d'hypothèse, l'interprétation des 

      résultats et le raffinement des hypothèses initiales. 

      En résumé, les travaux pratiques de modélisation moléculaire offrent aux étudiants une 

      expérience d'apprentissage interactive et stimulante, qui complète et enrichit leur formation 

      théorique. Ils constituent une étape essentielle vers la maîtrise des concepts et des 

      compétences nécessaires pour réussir dans le domaine de la chimie. 

  • III. Contenu

    • 1) Introduction  

      Les travaux pratiques en chimie générale jouent un rôle fondamental dans l'apprentissage de la chimie quantique. Ces expériences permettent aux étudiants de mettre en pratique les concepts théoriques abordés en cours, ainsi que de comprendre les principes fondamentaux qui régissent les réactions chimiques. 

      2) TP N°01 : Initiation à l'utilisation d'un logiciel de modélisation moléculaire( Gaussian09)

       Nous allons utiliser dans ce TP le programme gaussien dans l'environnement Windows.

       Pour démarrer un input file avec Gaussian09 pour un calcul de l'énergie d'un point unique, il faut suivre les étapes suivantes :

      ❖ Lancer le programme

      ❖ Entrer le fichier Gaussian09 input

      ❖ Exécution du job

      ❖ Examen et interprétation du fichier output

      ❖ Exemple L'énergie single point de l'eau 

      # hf/6-31g(d) test 

      Mon premier Gaussian job : énergie single point de l'eau H2O

      0 1 

      O -0.464  0.177  0.0 

      H -0.464  1.137  0.0

      H  0.441 -0.143 0.0

       Extraire le fichier output Recherché vers la fin « normal termination of Gaussian 09

       Recherché dans le fichier out put « scf done »

       SCF done : E(RHF)=-76.0098706218 au after 6 cycle

       Ceci indique que l'énergie du système est autour de -76.00987 hartrées .

      2) TP N°02 :: Représentation, visualisation et création de structures moléculaires à 2D et 3D.

       ➢ GaussView 

                 Est une interface graphique complète pour rendre l'utilisation de Gaussian plus intuitive et visualiser les résultats. 

                                         

      Avec Gauss-View on peut construire les systèmes moléculaires qui nous concernent rapidement et efficacement, en utilisant la fonction de construction des molécules.

       On peut également l'utilisez pour mettre en place et lancer les calculs Gaussian09, et pour visualiser les divers résultats. 

        Activité:

      - Construire les composées suivants avec le logiciel Gauss View

                                

      - Optimiser la géométrie de chaque molécule en utilisant la méthode RHF/6-31G(d)

       - Remplir le tableau suivant :


  • IV. Pré-requis

      • Maîtriser les concepts théoriques de base en chimie quantique, tels que les atomes, les molécules, les liaisons chimiques, les réactions chimiques, etc., à travers des cours théoriques de chimie générale. Effectuer des calculs d’énergie, enthalpie, etc.   

  • V. Place du cours dans le programme

      • Unité d’enseignement : Méthodologique  

  • VI. Visées d’apprentissage

    • Les travaux pratiques de modélisation moléculaire visent plusieurs objectifs d'apprentissage, notamment:  

      • Compréhension des concepts théoriques : Les travaux pratiques permettent aux étudiants d'appliquer les concepts théoriques abordés en classe dans un contexte expérimental. Cela renforce leur compréhension des principes fondamentaux de la chimie. 

      • Développement de compétences analytiques : En réalisant des expériences et en interprétant les résultats obtenus, les étudiants développent des compétences analytiques telles que l'observation, l'analyse critique des données et la résolution de problèmes. 

  • VII. Modalités d'évaluation des apprentissages

      • Test écrits : 

      Les étudiants peuvent être évalués à travers des tests écrits portant sur les concepts de la chimie quantique ainsi que sur les compétences pratiques acquises en laboratoire. Les questions peuvent inclure des problèmes à résoudre, des questions à choix multiples, des questions courtes, etc.   

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