Les micro-organismes des eaux douces et marines

Les eaux marines (océans) et les eaux douces (lacs, étangs, rivières, etc) sont des habitats importants pour plusieurs et différents micro-organismes ((algues, bactéries, champignons et protozoaires), ces habitats renferment les matières organiques en solution et les minéraux dissous permettent leur développement de tout germes (2)[1].

Dans cet écosystème ; La flore bactérienne est et très diversifiée : coques à Gram positif (microcoques), bacilles à Gram négatif (Pseudomonas, Flavobacterium, Acromonas, Alcaligenes et Acinetobacter), Il y a aussi les bactéries autotrophes (les cyanobactéries), et également certaines qui sont pathogènes et qui proviennent de l'intestin de l'homme et des animaux (entérobactéries, entérocoques, Clostridium). Pour les algues, on trouve dans les zones marines tempérées les diatomées et les dinoflagellés, alors que dans les eaux douces, on retrouve uniquement des diatomées. Concernant les protozoaires, ils ne constituent pas une partie importante du plancton, alors qu'en eau douce, la population est dominée par les ciliés (Colpidium, Euplotes). Les champignons, ne sont pas des organismes planctoniques importants, cependant, en eau douce leurs spores sont dispersées dans l'eau mais n'y croissent pas. Les seules formes libres sont les levures, les plus dominantes Candida parasilopsis, Cryptococcus, Rhodosporidium et Leucosporidium (3)[2].